Frederikshavn Kommune har en målsætning om at basere hele det samlede energiforbrug på vedvarende energikilder inden 2030. Det gælder naturligvis også Lille Skagen, og derfor opføres boligerne som lavenergihuse i bæredygtige materialer. Området forsynes med fjernvarme fra Skagen Varmeværk, der allerede er langt fremme med at anvende vedvarende energi, bl.a. ved at udnytte spildvarme fra fiskeindustrien og omdanne vindmøllestrøm til varme.
Ud over en stadig grønnere fjernvarme giver lokalplanen for Lille Skagen mulighed for at opsætte solceller. Af æstetiske hensyn må solcellerne alene placeres på taget af udhuse og carporte. Der er således lagt op til boliger med meget lavt energiforbrug, og da
bygningerne opføres i gedigne, vejrbestandige materialer, vil de fremtidige vedligeholdelsesudgifter også være små.